尿、子宮頸部、喀痰などの細胞をガラス板（プレパラート）にこすりつけて検査します。当院では婦人科領域の件数が最も多いです。腹水や胸水、甲状腺や乳腺にしこりを、細い針で細胞を吸引して調べる「穿刺吸引細胞診」もしています。

細胞診は組織診にくらべ、出血等の合併症が少ない一方、細胞がはがれてばらばらになっているため診断精度はやや下がります。しかし、子宮がん検診でおこなう子宮頚部細胞診は、組織診の結果とほぼ一致し、診断精度は高いとされています。（顕微鏡写真1）

生検でもっとも多い胃カメラや大腸カメラの生検は、ほとんどの場合がん細胞の有無を目的としていますが、胃潰瘍でのヘリコバクターピロリ細菌感染の有無や、炎症性腸疾患（IBD）での腸炎の検索を目的とした場合もあります。

肝機能障害や、蛋白尿や血尿といった腎機能障害の検査のためにおこなう肝生検や腎生検は、障害の程度を細胞から診断します。

がんで摘出した臓器は、癌の広がりはどの程度か、進行具合はどの程度か、悪性の度合いはどのくらいか、癌は十分取り切れているか、リンパ節や他の臓器への転移がないかなどを詳細に調べ報告します。臨床診断が正しく、癌の広がり程度も間違いないかを確かめます。